ABSTRACT During the COVID-19 pandemic, surveillance systems for vaccine-preventable diseases should remain active. The purpose of the present communication is to warn about the weakening of invasive pneumococcal disease surveillance in Cuba during the year 2020. To achieve such an end, a retrospective analysis was conducted of the number of invasive pneumococcal disease cases confirmed at the Cuban National Reference Laboratory in the period 2014-2020. From 2014 to 2019 the number of Streptococcus pneumoniae isolates ranged between 81 and 121. In 2020 only 31 isolates were confirmed, 19 of which were retrieved from meningitis and a mere five from pneumonia. The health actions implemented to contain the spread of the COVID-19 pandemic may have influenced the decline in the number of isolated responsible for invasive pneumococcal disease. This situation seems to be a consequence of the weakening of surveillance, since COVID-19 diagnostic tests became a priority during 2020.

RESUMEN Durante la pandemia de COVID-19 deben mantenerse activos los sistemas de vigilancia de enfermedades prevenibles mediante vacunación. El objetivo de la presente comunicación es alertar sobre el debilitamiento de la vigilancia de la enfermedad neumocócica invasiva en Cuba durante el 2020. Para ello se realizó un análisis retrospectivo del número de casos con enfermedad neumocócica invasiva confirmado en el Laboratorio Nacional de Referencia, Cuba 2014-2020. Entre el 2014 y 2019 el número de aislados de Streptococcus pneumoniae osciló entre 81 y 121. Durante el 2020 solo se confirmaron 31 aislados; 19 de ellos se recuperaron de meningitis y únicamente cinco de neumonía. Las medidas sanitarias implementadas para contener el avance de la pandemia COVID-19 pueden haber influido en la disminución de aislados responsables de enfermedad neumocócica invasiva. Esto parece obedecer al debilitamiento de la vigilancia, pues las pruebas para el diagnóstico de la COVID-19 se convirtieron en una prioridad durante el 2020.

Introduction: the Klebsiella genus gives rise to many hospital outbreaks due to multi-drug-resistant strains on different continents and leads to increased morbidity and mortality. Objectives: to identify the Klebsiella species causing infections in Cuban hospitals, to determine the origin of isolates per service, their antimicrobial susceptibility and, to determine the production and type of extended-spectrum ß-lactamases (ESBLs) and the susceptibility of these isolations to several antimicrobials of therapeutic interest. Methods: a descriptive study was conducted on 448 Klebsiella spp. Isolates that were received in the national reference microbiology laboratory of "Pedro Kouri" Institute of Tropical Medicine from 40 hospitals located in 12 Cuban provinces during the 2010-2012 period. Species identification was based on conventional biochemical tests and mass spectrometry technique called MS MALDI-TOF. The susceptibility to 15 antimicrobials and the extended spectrum ß-lactamase production were determined by the E-test method and by the combined disks method, respectively, according to recommendations of the Institute of Clinical and Laboratory Standards. The polymerase chain reaction made it possible the detection of BlaESBL genes as indicated in the previously described protocol. Results: Klebsiella pneumoniae (95.4 %) was the prevalent species, followed by K. oxytoca (4.1%), and K. ozaenae (0.5 %). The isolates were mainly from the intensive care units (26.3 %), surgery (22 %), and neonatology (13%) services. The highest resistance rate was observed for cephalosporins (48-52 %), trimethoprim-sulfamethoxazole (49 %), gentamicin (43 %), nalidixic acid (38 %), and tetracycline (34 %). Fifty-two percent of the isolates were extended spectrum ß-lactamase producers, with CTX-M (82 %) and TEM (70 %) enzymes prevailing. Conclusions: This study shows the clinical impact of Klebsiella spp in Cuban hospitals, which is highly resistant to different antimicrobials. The production of extended spectrum ß-lactamases provides a significant resistance mechanism in Klebsiella in which carbapenems, piperacillin-tazobactam, cholistin and tigecycline play an important therapeutic role.

Introducción: el género Klebsiella causa brotes hospitalarios, por cepas multidrogorresistentes en diferentes continentes y conlleva a un aumento en la morbimortalidad. Objetivos: identificar las especies de Klebsiella causantes de infecciones en hospitales cubanos, determinar la procedencia de los aislamientos según el servicio, y la susceptibilidad antimicrobiana, conocer la prevalencia de aislamientos productores de ß-lactamasas de espectro extendido (BLEE), y tipos, así como la susceptibilidad de los mismos a diferentes antimicrobianos de interés terapéutico. Métodos: se realizó un estudio descriptivo en 448 aislamientos de Klebsiella spp. recibidos en el Laboratorio Nacional de Referencia de Microbiología del IPK (LRNM/IPK) procedentes de 40 hospitales de 12 provincias del país durante el período de 2010 a 2012. La identificación de las especies se realizó mediante pruebas bioquímicas convencionales y por la técnica de Espectrometría de masas MS MALDI-TOF. Se determinó la susceptibilidad a 15 antimicrobianos mediante el método E-test y la producción de BLEE mediante el método de discos combinados según las recomendaciones del Instituto de Estándares Clínicos y de Laboratorio. Los genes blaESBL se determinaron mediante la reacción en cadena de la polimerasa según protocolo descrito previamente. Resultados: la especie prevalente fue Klebsiella pneumoniae (95,1 %), seguida por K. oxytoca (4,5 %) y K. ozaenae (0,4 %). Los aislamientos procedieron, principalmente, de los servicios de Unidades de Cuidados Intensivos (26,3 %), cirugía (22 %) y neonatología (13 %). La mayor resistencia se observó para las cefalosporinas (48-52 %), trimetoprim-sulfametoxazol (49 %), gentamicina (43 %), ácido nalidíxico (38 %) y tetraciclina (34 %). El 52 % de los aislamientos fueron productores de BLEE y prevaleció la enzima CTX-M (82 %) y la TEM (70 %). Conclusiones: se evidencia la repercusión clínica de Klebsiella spp. en hospitales cubanos con elevada resistencia a diferentes antimicrobianos. La producción de BLEE es un mecanismo de resistencia importante en esta bacteria en las que los carbapenémicos, la piperacilina-tazobactam, la colistina, y la tigeciclina juegan un rol terapéutico importante.

OBJECTIVE: To identify infection-causing Enterococcus species in Cuban hospitals and determine their susceptibility to antimicrobial drugs, as well as their resistance mechanisms. METHODS: A total of 687 Enterococcus isolates from 30 Cuban hospitals in nine provinces of the country were studied over the period 2000-2009. The species were identified using both the conventional method and the automatic API® system. The minimum inhibitory concentration was determined for 13 antimicrobial drugs following the standards recommended by the Clinical Laboratory and Standards Institute. The polymerase chain reaction technique was used to characterize the genes that were resistant to aminoglycosides, erythromycin, tetracycline, and glucopeptides. The presence of beta-lactamase was determined by the chromogenic cephalosporin test. RESULTS: The most prevalent species were Enterococcus faecalis (82.9%) and E. faecium (12.2%). Resistance to glucopeptides (1.0%) was mediated by the vanA and vanB genes. The strains resistant to ampicillin (6%) did not produce beta-lactamases. A high percentage of resistance to aminoglycosides was observed. Gentamicin (31.0%) and streptomycin and amikacin (29.1%) were mediated by the aac(6')Ie-aph(2")Ia, aph(3')-IIIa, ant(6)Ia, and ant(3")(9) genes. A correlation was found between resistance to tetracycline (56.0%) and presence of the tet(M) (75.1%) and tet(L) genes (7.0%), while resistance to erythromycin (34.1%) was due to the erm(B) gene (70.9%). CONCLUSIONS: Resistance to vancomycin is infrequent in Cuba, as opposed to a high level of resistance to aminoglycosides, which may be indicative of treatment failures. The microbiology laboratory is a cornerstone of Enterococcus infection surveillance, along with ongoing monitoring of the susceptibility of these infections to antimicrobial drugs at a time when resistance of this microorganism is on the rise.

OBJETIVO: Identificar las especies de Enterococcus causantes de infecciones en hospitales cubanos, su susceptibilidad a los antimicrobianos y sus mecanismos de resistencia. MÉTODOS: Se estudiaron 687 aislamientos de Enterococcus procedentes de 30 hospitales cubanos de nueve provincias del país durante el período de 2000 a 2009. La identificación de las especies se realizó mediante el método convencional y sistema automatizado API®. La concentración inhibitoria mínima se determinó para 13 antimicrobianos según las recomendaciones del Instituto de Estándares Clínicos y de Laboratorio. Se determinaron los genes de resistencia a aminoglucósidos, eritromicina, tetraciclina y glucopéptidos mediante reacción en cadena de la polimerasa. La presencia de betalactamasa se determinó por el método de la cefalosporina cromógena. RESULTADOS: Las especies más prevalentes fueron Enterococcus faecalis (82,9%) y Enterococcus faecium (12,2%). La resistencia a los glucopéptidos (1,0%) estuvo mediada por los genes vanA y vanB y las cepas resistentes a ampicilina (6%) no produjeron betalactamasas. Se observó un alto porcentaje de resistencia a los aminoglucósidos: gentamicina (31,0%) y estreptomicina y amikacina (29,1%) mediada por los genes aac(6')Ie-aph(2")Ia, aph(3')-IIIa, ant(6)Ia, ant(3")(9). Hubo correlación entre la resistencia a tetraciclina (56,0%) y la presencia de los genes tet(M) (75,1%) y tet(L) (7,0%), mientras que la resistencia a eritromicina (34,1%) obedeció al gen erm(B) (70,9%). CONCLUSIONES: La resistencia a vancomicina es infrecuente en Cuba, a diferencia del alto nivel de resistencia a los aminoglucósidos, que sugiere posibles fracasos terapéuticos. El laboratorio de microbiología constituye un pilar fundamental de la vigilancia de las infecciones por cepas de Enterococcus y el monitoreo continuo de su susceptibilidad a los antimicrobianos, dado el incremento de la resistencia de ese microorganismo en el tiempo.

INTRODUCTION: since 2006 in Cuba, there has been difficult to determine the actual incidente of bacterial meningitis and other invasive diseases caused by Streptococcus pneumoniae, as a result of the low percentage of isolation and identification of this agent in the domestic microbiology lab network. OBJECTIVE: to warn of the need of revitalizing the active surveillance of invasive, epidemiological and microbiological pneumoccocic diseases, mainly meningitis and pneumoniae in the phase prior to vaccination. METHODS: a comparison was made on the circulation of capsulary serogroups/serotypes and the invasive infection-causing S. pneumoniae isolates susceptibility to penicilline in two periods: 1994-2006 and 2007-2009. RESULTS: the most frequent serogroups were 3, 6, 7, 9, 14, 17, 18, 19, 20 and 23; however, in the second period, it was observed that others not contained in the available conjugate vaccines (serogrup 15) and associated to antimicrobial resistance (serotype 5) were circulating. On the other hand, increased resistance to penicilline was evident. CONCLUSIONS: it is required to study a more representative number of isolates in order to assure high effectiveness with the incorporation of some S. pneumoniae conjugate vaccines in the Cuban infant vaccination schedule. This will also allow duly assessing increased resistance to penicilline and adopting therapeutical guidelines suited to the Cuban setting.

INTRODUCCIÓN: en Cuba, a partir de 2006, ha sido difícil establecer la incidencia real de las meningitis bacterianas y otras enfermedades invasivas por Streptococcus pneumoniae, como consecuencia del bajo porcentaje de aislamiento e identificación de este agente en la red de laboratorios de microbiología del país. OBJETIVO: alertar sobre la necesidad de revitalizar la vigilancia activa de la enfermedad neumocócica invasiva, epidemiológica y microbiológica, fundamentalmente las meningitis y neumonías, en la etapa previa a la vacunación. MÉTODOS: se compararon la circulación de los serogrupos/serotipos capsulares y la susceptibilidad a penicilina de los aislamientos de S. pneumoniae responsables de infecciones invasivas, en dos períodos de la vigilancia: años 1994-2006 y 2007-2009. RESULTADOS: los serogrupos más frecuentes fueron: 3, 6, 7, 9, 14, 17, 18, 19, 20 y 23, pero se constató durante el segundo período de estudio, la circulación de otros no contenidos en las vacunas conjugadas disponibles comercialmente (serogrupo 15) y asociados a resistencia a antimicrobianos (serotipo 5). Por otra parte, se puso de manifiesto un incremento de la resistencia a la penicilina. CONCLUSIONES: para garantizar una alta efectividad con la inclusión en el calendario de vacunación infantil en Cuba, de alguna de las vacunas conjugadas contra S. pneumoniae, se impone el estudio de un número más representativo de aislamientos. Esto también permitirá hacer una correcta evaluación de la tendencia al incremento de la resistencia a la penicilina y adoptar guías de tratamiento adecuadas en el medio cubano.